不动产登记转移申请表丢失后，可以按照以下步骤进行处理：
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1. 联系原登记机构：应联系原不动产登记机构，说明情况，了解如何补办。
2. 准备相关材料：通常需要准备以下材料：
身份证明材料；
不动产权利证书；
房屋买卖合同或赠与合同等转移原因的证明材料；
补办申请表。
3. 填写申请：在登记机构提供的申请表上填写相关信息，并签字或盖章。
4. 提交材料：将填写好的申请表和相关材料提交给不动产登记机构。
5. 等待审核：登记机构会对提交的材料进行审核，确认无误后，会重新出具一份申请表。
6. 办理登记：在补办申请表后，按照正常流程继续办理不动产转移登记。
7. 缴纳费用：根据当地规定，补办申请表可能需要缴纳一定的费用。
不同地区可能存在细微差别，具体操作时应以当地不动产登记机构的要求为准。如有疑问，建议咨询当地不动产登记机构或专业律师。
