港口航运专业硕士毕业生在报考公务员时，可以关注以下几个方向的职位：
1. 海事局：负责海上交通安全、船舶及港口管理、水上交通安全监管等，港口航运专业硕士毕业生可以报考海事局的相关职位。
2. 交通运输局：负责公路、水路、铁路、民航等交通运输的综合管理，港口航运专业硕士毕业生可以报考交通运输局的海事管理、航道管理等相关职位。
3. 海事公安局：负责海上治安管理、海上交通安全等，适合有法学背景或对海事管理有兴趣的专业硕士报考。
4. 海关：负责进出口货物、运输工具、个人物品的监管，港口航运专业硕士毕业生可以报考海关的船舶监管、货物监管等相关职位。
5. 海事法院：负责海事、海商案件的审判，适合法学背景或对海事法律有兴趣的专业硕士报考。
6. 航道管理局：负责航道规划、建设、维护等，港口航运专业硕士毕业生可以报考航道规划、航道建设等相关职位。
7. 海事救助局：负责海上搜救、应急管理等，适合对海上救援有兴趣的专业硕士报考。
公务员职位通常会有严格的报考条件，包括专业限制、学历要求、工作经验等。因此，在准备报考时，建议详细查看各个职位的具体要求，选择最适合自己的职位进行报考。同时，也可以关注国家公务员局等官方渠道发布的最新招聘信息。
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